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龙眼纤维素合成酶基因家族成员鉴定及表达模式

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为探究龙眼纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼C ESA (DICESA)家族成员鉴定、蛋白特性和保守基序分析、分子进化树分析、FPKM值分析,并利用qRT-PCR技术分析DICESA基因的表达模式.结果表明,DICESA家族包含9个基因成员,家族成员内含子数量8-13个不等,且蛋白理化性质相近,均包含15个保守的motif;系统进化树分析表明DICESA分布于6个分支上;顺式作用元件分析表明DICESA家族启动子序列含有众多植物激素响应、厌氧响应等元件;FPKM值分析表明DICESA家族在NEC阶段高表达,大部分成员在体胚发生过程中呈现下调表达趋势;除DICESA7-2外其余DICESA基因在龙眼不同组织部位都有所表达.qRT-PCR分析表明,4个DICESA基因在非胚性阶段表达量较高;DICESA成员可被ABA和MeJA下调表达.本研究表明DICESA可能参与龙眼生殖生长和体胚发生进程,并响应逆境胁迫.
Identification and expression patterns of the cellulose synthase gene family in Dimocarpus Iongan Lour

朱永静、路保顺、张舒婷、刘蒲东、李小斐、赖钟雄、林玉玲

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福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州350002

龙眼 纤维素合成酶 生物信息学分析 表达分析

国家自然科学基金福建省高原学科建设经费福建农林大学创新基金

31672127102/71201801101CXZX2018078

2020

应用与环境生物学报
中国科学院成都生物研究所

应用与环境生物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.972
ISSN:1006-687X
年,卷(期):2020.26(5)
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