应用与环境生物学报2024,Vol.30Issue(2) :410-414.DOI:10.19675/j.cnki.1006-687x.2023.04018

基于核酸适配体的蛋白靶向降解工具用于EGFR的降解

EGFR was degraded using aptamer-based protein-targeting degradation tools

许燕 袁奕 杜凤 董娟 崔欣 王启卫 唐卓
应用与环境生物学报2024,Vol.30Issue(2) :410-414.DOI:10.19675/j.cnki.1006-687x.2023.04018

基于核酸适配体的蛋白靶向降解工具用于EGFR的降解

EGFR was degraded using aptamer-based protein-targeting degradation tools

许燕 1袁奕 2杜凤 2董娟 2崔欣 2王启卫 3唐卓2
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作者信息

  • 1. 中国科学院成都有机化学研究所 成都 610213;中国科学院成都生物研究所 成都 610095;中国科学院大学 北京 100049
  • 2. 中国科学院成都生物研究所 成都 610095
  • 3. 西华大学 成都 610039
  • 折叠

摘要

目前基于核酸的蛋白质水解-靶向嵌合体(PROTAC)为降解一些不可成药的靶标提供了强有力的工具.我们报告过基于核酸适配体的PROTAC作为一种拓宽靶标的降解工具,目标蛋白RNA适配体作为靶向降解弹头,异双功能分子Dth可以将E3泛素连接酶招募到基因编码的适体RNA支架上,促进靶蛋白的泛素化并将其降解.通过将膜蛋白表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)的适配体在RNA支架上表达,小分子Dth适当浓度作用下,实现了对EGFR的选择性降解,将此工具的靶标扩展到膜蛋白.另外,通过在RNA支架上共同表达EGFR和p50的适配体,小分子Dth适当浓度作用下,实现了同时对p50和EGFR的降解.本研究基于核酸适配体的PROTAC降解工具提供了一个通用平台,可用于后续生化研究和潜在的疾病治疗.(图4表1参25)

Abstract

Recently,nucleic acid-based proteolytic targeting chimeras(PROTAC)have provided powerful tools for degrading these undruggable targets.We previously reported an Aptamer-based PROTAC as a target-broadening degradation tool and target protein RNA aptamers as targeted degradation warheads.The hetero-functional molecule Dth recruits E3 ubiquitin ligase to the aptamer RNA scaffold encoded by the gene to promote target protein ubiquitination and degradation.In this study,aptamers of the membrane protein,epidermal growth factor receptor(EGFR),were expressed on RNA scaffolds.Under an appropriate concentration of the small molecule Dth,selective EGFR degradation was achieved,and the target of this tool was extended to membrane proteins.In addition,by co-expressing EGFR and p50 aptamers on RNA scaffolds,the degradation of p50 and EGFR was achieved simultaneously under the action of an appropriate concentration of the small molecule Dth.This aptamer-based PROTAC degradation tool provides a common platform for subsequent biochemical research and potential disease treatment.

关键词

核酸适配体/蛋白靶向降解/RNA支架/表皮生长因子受体

Key words

aptamer/protein-targeted degradation/RNA scaffold/EGFR

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基金项目

国家自然科学基金(22177111)

国家自然科学基金(21907090)

国家自然科学基金(21877108)

四川省科技计划(2022YFS0012)

四川省科技计划(2022YFS0432)

四川省中央地方科技发展指导基金(2022ZYD0090)

四川省中央地方科技发展指导基金(2021ZYD0094)

四川省医学科研计划(SKLTCM2022011)

成都市科技局项目(2021-YF05-01739-SN)

成都市科技局项目(2021-YF08-00155-GX)

中国青年创新促进会项目(20203650)

出版年

2024
应用与环境生物学报
中国科学院成都生物研究所

应用与环境生物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.972
ISSN:1006-687X
参考文献量25
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