不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析

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中文摘要：D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性.基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为 5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/CA2019谱系.不同于甲型、乙型流感病毒,IDV的潜在N-糖基化位点主要集中分布在HEF基因上.为系统了解不同谱系毒株HEF蛋白的N-糖基化位点和B细胞表位,从GenBank数据库获得 151条全长HEF基因序列,通过使用MEGA-X生物信息学软件构建遗传进化树,并用在线工具进行各毒株N-糖基化位点和线性B细胞表位预测分析.结果表明IDV的HEF蛋白具有6～8个潜在的N-糖基化位点,其中有2个N-糖基化位点(N146和N613)在不同谱系间相同,有6个N-糖基化位点(N28、N54、N249、N346、N390和N513)在不同谱系间存在差异.B细胞表位在不同谱系间有 3个保守的表位和 8～9个各谱系独特的表位.线性B细胞表位的预测将有助于设计激活体液反应的多表位疫苗,预测结果还需要体外和体内实验证实来证明该应用的可行性.

作者：

蒋智勇、周霞、李春玲、楚品品、勾红潮、李艳、卞志标、刘建营、翟少伦

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作者单位：

广东省农业科学院动物卫生研究所猪病研究室/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站广州 510640

广东省农业技术推广中心广州 510640

关键词：

D型流感病毒谱系 HEF蛋白 N-糖基化位点 B细胞表位预测

基金：

广东省自然科学基金项目

项目编号：

2021A1515010524

出版年：

2024

DOI：

10.3969/j.issn.1008-4754.2024.10.058

中国动物保健

中国乡镇企业协会　北京中美欧畜牧科学研究院有限公司

中国动物保健

影响因子：0.119

ISSN：1008-4754

年,卷(期)：2024.26(10)