基于生物信息学的糖尿病肾病差异表达基因筛选和发病机制研究

The differential gene expression and pathogenesis in diabetic nephropathy based on bioinformatics research

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中文摘要：目的利用生物信息学方法探讨糖尿病肾病(DN)差异基因的表达和发病机制.方法检索获取美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库并获取DN外周血单个核细胞的基因表达芯片GSE142153数据集,筛选样本差异表达基因数据进行富集分析并筛选核心靶点,利用基因集富集分析方法筛选DN差异表达基因富集的生物学功能.结果筛选获得DN差异表达基因160个,涉及肿瘤坏死因子(TNF)、NOD样受体(NLR)、核转录因子Kappa B(NF-κB)、白细胞介素17(IL17)、趋化因子(CC)等信号通路,经拓扑及基因集富集分析,白细胞介素6(IL6)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素1B(IL1B)、细胞表面趋化因子受体2(CCR2)、趋化因子(C-X3-C-基元)受体1(CX3CR1)是DN发病过程中的核心靶点.结论 DN差异表达基因主要富集于炎性反应、脂质代谢等信号通路,涉及血管新生、细胞凋亡、缺氧、凝血等生物学过程.

作者：

李君、李见、王世信

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作者单位：

枣庄市立第四医院枣庄市皮肤病性病防治院内一科,山东枣庄 277599

徐州市中心医院检验科,江苏徐州 221009

关键词：

糖尿病肾病发病机制生物信息学

出版年：

2021

DOI：

10.3969/j.issn.1672-9463.2021.09.005