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进口黄水仙基于RAD-Seq的SNP标记开发与分析

Development and Analysis of SNP Loci for Imported Narcissus pseudonarcissus Based on RAD-seq

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为对海量进口黄水仙鳞茎观赏花卉进行快速高精准鉴定,开发其特异性单核苷酸多态性分子标记位点,本研究通过对4种不同进口黄水仙品种和中国水仙共18个样品进行高通量简化基因组测序,得到进口黄水仙简化基因组信息;通过构建简化基因组文库和分子标记检测,得到简化基因组有效数据97.33 G,开发出群体单核苷酸多态性分子标记12532个;通过主成分分析和构建遗传关系邻接树分析,可高分辨率鉴定出所有参试水仙属鳞茎花卉品种.利用高通量简化基因组测序技术,可高效率、低成本地开发大量用于进口黄水仙鳞茎花卉精准鉴定的单核苷酸多态性分子标记,为海关在口岸执法把关提供技术支撑.

于文涛、张明哲、沈建国、袁向芬、尹文秀、吕继洲

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福州海关技术中心福建省检验检疫技术研究重点实验室 福州350001

杭州海关技术中心浙江省检验检疫科学技术研究院 杭州310001

中国检验检疫科学研究院动物检疫研究所 北京100001

黄水仙 简化基因组测序 单核苷酸多态性 分子鉴定 鳞球茎花卉

国家重点研发计划项目海关总署科研项目福建省林业科学研究资助项目

2017YFF02103022019HK043H2014009

2021

中国口岸科学技术
中国质检报刊社

中国口岸科学技术

影响因子:0.051
ISSN:1002-4689
年,卷(期):2021.(4)
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