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双胚苗水稻中单倍体与二倍体基因表达芯片分析

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本研究运用基因芯片技术,对双胚苗水稻SAR Ⅱ-628品系中的单倍体及其对应二倍体的RNA水平的表达变化情况进行对比分析,发现单倍化后基因表达迅速发生了不同程度的变异,主要结果如下:(i)单倍化后,表达变化的序列占水稻总探针序列的2.47%,随机分布在水稻的12条染色体上,激活的序列数量多于沉默的;(ii)有33个序列在染色体上的分布具有成簇分布的特点;(iii)对单倍化中已经预测功能的575条序列进行功能分类,发现都涉及了生物过程、细胞成份和分子功能这3个方面.SNF2家族中控制转录调节的位点表达下降居多;与DNA重组修复相关的RAD54家族中只有2个位点分别发生了表达上升和降低的变化;(iv)采用RT-PCR验证基因芯片的结果,总体上83.78%序列表达结果与芯片结果相符;任选7个极端(激活和沉默)表达方式的序列,其表达结果与芯片相符率达到91.86%.

张红宇、彭海、李平川、邓其明、徐培洲、李云、汪旭东、吴先军

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四川农业大学水稻研究所,温江611130

西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室,雅安625014

江汉大学生命科学学院,武汉430056

成都市农林科学院作物研究所,温江611130

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水稻(Oryzasa tiva L.) 双胚苗 二倍体 单倍体 基因芯片 基因表达

国家自然科学基金教育部长江学者和创新团队发展计划

30771157IRT0453

2008

中国科学(生命科学)
中国科学院

中国科学(生命科学)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.725
ISSN：1674-7232
年,卷(期)：2008.38(7)
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