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增强子靶标基因的预测方法研究

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增强子是作为基因组顺式调节元件的功能性DNA片段,通过与靶基因启动子的相互作用调节基因表达.识别增强子和靶标基因的相互作用对理解基因调控、细胞分化和疾病发展的机制有重要意义.然而,通过实验方法鉴定增强子靶标基因(enhancer-target gene,ETG)在时间、人力和金钱方面都花费太多.因此,越来越多的研究工作集中在开发计算方法来解决这一问题.本文对用于ETG预测的计算方法进行系统的总结,以促进其应用.最后,探讨了该领域提出的现有解决方案存在的限制和挑战并展望了未来的研究方向.
Computational methods to predict Enhancer-target Gene Pairs

enhancersgene expressionenhancer and target genecomputational method

徐晓强、崔婷、张涵、尚德思、李春权

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南华大学衡阳医学院附属第一医院,人工智能与大数据中心,衡阳 421001

增强子 基因表达 增强子和靶标基因 计算方法

湖南省自然科学基金湖南省自然科学基金

2023JJ305362023JJ30535

2023

中国科学(生命科学)
中国科学院

中国科学(生命科学)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.725
ISSN:1674-7232
年,卷(期):2023.53(10)
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