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肺癌患者外周血和胸腔积液T细胞受体组库特征分析

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目的 比较肺癌患者外周血和胸腔积液的T细胞受体(TCR)组库的免疫学特征.方法 收集2020年7月至2021年1月在复旦大学附属中山医院就诊的5例合并恶性胸腔积液肺癌患者的外周血和胸腔积液,分离外周血单个核细胞(PBMC)和胸腔积液单个核细胞(PEMC),提取基因组DNA,采用Illumina MiSeq平台对TCR进行高通量测序,分析TCR组库的多样性等特征.结果 PBMC和PEMC中的TCR克隆型、VJ pairs和互补决定区3(CDR3)序列的多样性和相关性差异均无统计学意义.PBMC中检测到的TCR克隆数量高于PEMC(P<0.05),VJ pairs和CDR3数量与PEMC差异无统计学意义.PBMC和PEMC配对样本的共有VJ pairs数量占总VJ pairs的比例高于共有克隆型和CDR3序列的数量比例(P<0.05),后两者差异无统计学意义.PEMC中高扩增克隆(HEC)数量和占比均高于PBMC.同时鉴定了36个在PBMC和PEMC中差异表达的VJ pairs,其中25个在PEMC中表达升高、9个在PEMC中表达降低.结论 肺癌患者外周血和胸腔积液的TCR组库表现出不同的特征性变化,可能为肺癌重要的免疫病理学特征.
Characteristics of T cell receptor repertoire in peripheral blood and pleural effusion of lung cancer patients

lung cancermalignant pleural effusionT cell receptor repertoireperipheral blood mononuclear cellpleural effusion mononuclear celldiversity

宋娟、王林林、胡洁、宋元林、童琳

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复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科,上海 200032

上海市重大传染病与生物安全研究院,上海 200032

肺癌 恶性胸腔积液 T细胞受体组库 外周血单个核细胞 胸腔积液单个核细胞 多样性

国家自然科学基金上海市临床重点专科建设项目上海市科委上海市肺部炎症与损伤重点实验室项目上海市科委上海工程技术研究中心建设项目

82170088shslczdzk0220120DZ226120020DZ2254400

2024

10.12025/j.issn.1008-6358.2024.20231869

中国临床医学
复旦大学附属中山医院

中国临床医学

CSTPCD
影响因子：1.002
ISSN：1008-6358
年,卷(期)：2024.31(1)
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