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m6A-脂肪酸代谢相关lncRNA对结肠癌预后及免疫疗效的预测价值

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目的 探讨结肠癌中m6A-脂肪酸代谢相关lncRNA,并分析其与患者预后及肿瘤免疫微环境的相关性,为结肠癌患者诊治提供新的分子靶点.方法 从TCGA数据库中获取结肠癌患者的转录组数据及临床信息.通过Pearson相关分析筛选出m6A-脂肪酸代谢相关lncRNA.采用单因素、LASSO及多因素Cox回归分析构建基于lncRNA表达的风险模型;通过Kaplan-Meier生存曲线、ROC曲线及列线图验证风险模型的准确性.比较高风险组及低风险组结肠癌患者免疫细胞浸润情况.结果 从TCGA数据库中鉴定出670个m6A相关lncRNA及1011个脂肪酸代谢相关lncRNA,其中39个交叉的lncRNA具有预后意义.通过LASSO及多因素回归构建了包含5个m6A-脂肪酸代谢相关lncRNA的风险模型,风险评分较高者预后较差.多因素Cox回归分析表明风险评分是影响患者预后的独立相关因素(HR=11.8,95%CI 3.6~38.7).ROC曲线显示其预测患者1年、3年、5年生存率的曲线下面积分别为0.758(95%CI 0.611~0.905)、0.793(95%CI 0.708~0.877)和0.815(95%CI 0.722~0.907).相较于高风险组,低风险组肿瘤有更多的M1型巨噬细胞浸润(P<0.05),免疫检查点基因(CD44、TNFRSF9、CD40LG、CD48、CD244、IDO1、HAVCR2、CD27、ICOS、LAIR1、TMIGD2、CD28、TIGIT)表达增高(P<0.05).结论 该m6A-脂肪酸代谢相关lncRNA风险模型可用于预测结肠癌患者预后及免疫疗效.
Predictive values of m6A-fatty-acid-metabolism-related lncRNA in prognosis and immune efficiency of colon cancer

colon cancerm6Along non-coding RNAfatty acid metabolismimmunotherapy

沈超琴、刘韬韬

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复旦大学附属中山医院消化科,上海 200032

结肠癌 m6A 脂肪酸代谢 lncRNA 免疫治疗

国家自然科学基金上海市青年科技英才"扬帆计划"项目

8210324621YF1425900

2024

中国临床医学
复旦大学附属中山医院

中国临床医学

CSTPCD
影响因子:1.002
ISSN:1008-6358
年,卷(期):2024.31(1)
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