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古尔班通古特沙漠地衣结皮中可培养细菌多样性初探

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为了解古尔班通古特沙漠优势结皮类型——地衣结皮中可培养细菌的多样性,利用3种培养基经稀释涂布和划线分离得到18株纯培养菌株.对分离的所有菌株提取基因组DNA,利用细菌通用引物扩增得到16S rDNA的序列并测序.结果表明:(1)基于Ribosomal Database Project (RDP)在线归类分析,18株菌可初步归为3门3纲3目6科6属,未见新属,未分离到固氮菌属(Azotobacter).其中,6株归为变形菌门(Proteobacteria)、6株属于放线菌门(Actinobacteria)、6株属于厚壁菌门(Firmicutes)；不动杆菌属(Acinetobacter)、链霉菌属(Streptomyces)、芽孢杆菌属(Bacillus)为优势属,分别占分离菌株数的33％、28％、22％.(2)在EzTaxon-e数据库中对各菌株序列进行进一步的BLAST同源性分析表明,18株菌可进一步归为14个OTUs(Operational Taxonomic Unit),未见疑似新种(同源性均＞97％),其中链霉菌属OTU比例最高(35.71％),依次为不动杆菌属和芽孢杆菌属(二者均为21.43％).(3)古尔班通古特沙漠地衣结皮中的可培养细菌Shannon-Wiener多样性指数为2.5532,均匀度指数为0.9675.(4)上述可培养细菌在生物土壤结皮中具有固沙、加速矿化、生防等多重生态潜能.
Culture-dependent Bacteria Diversity of Lichen Crusts in the Gurbantunggut Desert

吴楠、张元明、潘惠霞、邱东

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中国科学院新疆生态与地理研究所 干旱区生物地理与生物资源重点实验室,新疆乌鲁木齐830011

新疆农业大学 草业与环境科学学院,新疆乌鲁木齐830052

原核生物 RDP在线归类 EzTaxon-e数据库 Shannon-Wiener多样性指数 链霉菌属

新疆维吾尔自治区青年科学基金中国科学院"西部之光"资助项目中国科学院"西部之光"资助项目科技部国际合作项目国家自然科学基金

2009211B31XBBS200906XBBS2011032010DFA9272041271281

2013

10.7522/j.issn.1000-694X.2013.00102

中国沙漠
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所

中国沙漠

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.504
ISSN：1000-694X
年,卷(期)：2013.33(3)
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