首页|基于转录组测序的斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)干旱胁迫应答基因表达分析

基于转录组测序的斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)干旱胁迫应答基因表达分析

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
荒漠植物斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)主要分布在中国西北地区的固定或半固定沙漠,具有较高的干旱环境适应能力,但对它的干旱胁迫耐受分子机制研究较少.本研究利用Illumina测序技术筛选斧翅沙芥干旱应答基因,通过转录组的从头组装,共获得154 875个unigenes,平均长度为1 437个碱基.干旱胁迫后,共有13 855个基因表达发生显著变化,其中7 182个基因上调表达,6 673个基因下调表达.GO功能富集分析表明差异表达基因显著富集到物质代谢、氧化还原和催化活性等功能;KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集到氨基酸代谢、淀粉和糖代谢以及植物激素信号转导等途径.此外,鉴定到47个干旱诱导转录因子家族,主要包括HSF、ERF、WRKY、MYB、bHLH等.与沙芥相比,淀粉和糖代谢途径以及大量热胁迫转录因子在干旱胁迫后上调表达有可能是斧翅沙芥提高干旱胁迫耐受能力的特殊途径.本研究的结果初步揭示了斧翅沙芥对抗干旱胁迫的调控特征,为进一步理解斧翅沙芥干旱环境适应的分子机制提供线索.
Transcriptiomic analysis of drought response genes in Pugionium dolabratum

王玮、王悦、厉万荣、王浩澎、杨宁

展开 >

西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州730070

斧翅沙芥(Pugionium dolabratum) 干旱胁迫 转录组 转录因子

国家自然科学基金甘肃省高等学校创新能力提升项目西北师范大学青年教师科研能力提升计划

320601682019B-040NWNU-LKQN-17-4

2022

10.7522/j.issn.1000-694X.2022.00077

中国沙漠
中国科学院寒区旱区环境与工程研究所

中国沙漠

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.504
ISSN：1000-694X
年,卷(期)：2022.42(6)
  • 2