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面向COVID-19疫情预测的图卷积神经网络时空数据学习

Spatiotemporal data learning of graph convolutional neural network for epidemic prediction of COVID-19

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目的 当前的疾病传播研究主要集中于时序数据和传染病模型,缺乏运用空间信息提升预测精度的探索和解释.在处理时空数据时需要分别提取时间特征和空间特征,再进行特征融合得到较为可靠的预测结果.本文提出一种基于图卷积神经网络(graph convolutional neural network,GCN)的时空数据学习方法,能够运用空间模型端对端地学习时空数据,代替此前由多模块单元相集成的模式.方法 依据数据可视化阶段呈现出的地理空间、高铁线路、飞机航线与感染人数之间的正相关关系,将中国各城市之间的空间分布关系和交通连接关系映射成网络图并编码成地理邻接矩阵、高铁线路直达矩阵、飞机航线直达矩阵以及飞机航线或高铁线路直达矩阵.按滑动时间窗口对疫情数据进行切片后形成张量,依次分批输入到图深度学习模型中参与卷积运算,通过信息传递、反向传播和梯度下降更新可训练参数.结果 在新型冠状病毒肺炎疫情数据集上的实验结果显示,采用GCN学习这一时空数据的分布特征相较于循环神经网络模型,在训练过程中表现出了更强的拟合能力,在训练时间层面节约75％以上的运算成本,在两类损失函数下的平均测试集损失能够下降80％左右.结论 本文所采用的时空数据学习方法具有较低的运算成本和较高的预测精度,尤其在空间特征强于时间特征的时空数据中有着更好的性能,并且为流行病传播范围和感染人数的预测提供了新的方法和思路,有助于相关部门在公共卫生事件中制定应对措施和疾病防控决策.

杨成意、刘峰、齐佳音、段妍、吕润倩、肖子龙

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上海对外经贸大学人工智能与变革管理研究院,上海 200336

上海对外经贸大学统计与信息学院,上海 201620

华东师范大学计算机科学与技术学院,上海 200062

中山大学数据科学与计算机学院,广州 510006

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深度学习 图卷积神经网络(GCN) 时空数据处理 新冠肺炎 疫情预测

国家自然科学基金

72042004

2021

中国图象图形学报
中国科学院遥感应用研究所,中国图象图形学学会 ,北京应用物理与计算数学研究所

中国图象图形学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.111
ISSN：1006-8961
年,卷(期)：2021.26(5)
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