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BCAT1在肝癌中的表达、预后及免疫浸润的生物信息学分析
Bioinformatic analysis of BCAT1 expression,prognosis and immune infiltration in hepatocellular carcinoma
岳明强 1周艳彩 1卓亚 1王昕红1
作者信息
- 1. 新乡医学院第一附属医院感染科,河南新乡453100
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摘要
目的 探讨BCA1T1在肝癌中的表达及其与预后、免疫浸润的关系.方法 TCGA数据库分析多种肿瘤组织中BCAT1 mRNA的表达水平;GEPIA2数据库、HPA数据、TIMER数据库和LinkedOmics数据库分别分析BCAT1 mRNA的表达水平与肝癌患者的生存状态的关系、BCAT1表达定位、BCAT1与肝癌组织中免疫细胞浸润程度的相关性及共表达基因,对共表达基因进行GO、KEGG富集分析,Cytoscape软件鉴定肝癌中与BCAT1共表达基因的Hub基因.结果 BCAT1 mRNA在乳腺浸润癌、胆管癌、肝癌等均高表达(P＜0.05).BCAT1在肝癌组织细胞核呈现中等及高表达,在正常组织中呈弱表达或无表达.BCAT1 mRNA表达(高表达)是肝癌患者预后的独立危险因素(P＜0.05).BCAT1高表达的肝癌患者中位生存时间降低(P=0.001).肝癌组织中BCAT1 mRNA表达水平与B细胞、CD4+T细胞等浸润程度成正相关性(P＜0.001).共表达基因包括 APOH、CD86、SYK、AMBP、C3AR1、CYBB、MSR1、FTCD、SERPINC1和PROC.结论 BCAT1可作为肝癌患者预后不良的标志物,BCAT1可能通过影响免疫细胞浸润及代谢途径调控肝癌的发生发展.
关键词
肝癌/BCAT1/预后/富集分析/信号通路/代谢Key words
Hepatocellular carcinoma/BCAT1/Prognosis/Enrichment and analysis/Signaling pathway/Metabolize引用本文复制引用
基金项目
2020年新乡市科技攻关计划(GG2020028)
出版年
2023