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基于TCGA数据库分析肌动蛋白结合蛋白1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及对预后的影响

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目的 分析肌动蛋白结合蛋白1(fascin actin-bundling protein 1,FSCN1)在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)中的表达及与预后的关系.方法 TCGA数据库中下载HNSCC的RNASeq数据和临床特征数据,分析FSCN1在HNSCC中的表达及与预后的关系.LinkedOmics数据库分析HNSCC中与FSCN1的共表达基因并进行富集分析.结果 正常组织及HNSCC组织中FSCN1表达量分别为6.97(5.79,7.52)和9.10(8.54,9.56),FSCN1在HNSCC组织中高表达(P＜0.01);HNSCC组织及癌旁组织中FSCN1表达量分别为9.395(8.966,9.764)和7.084(5.907,7.543),HNSCC组织中FSCN1表达量升高(P＜0.01).N分期、淋巴及血管侵犯及FSCN1表达与患者的生存相关(P＜0.05).FSCN1的共表达基因主要富集的生物学过程包括细胞黏附、血管生成等,分子功能包括细胞黏附分子结合、钙黏着蛋白绑定等,细胞组分包括黏着斑、质膜等,KEGG通路包括黏着斑、肌动蛋白骨架的调控等信号通路.免疫组化证实,与癌旁组织相比,HNSCC患者癌组织中FSCN1表达水平升高(x2=19.285,P＜0.001),FSCN1主要表达于细胞胞浆中.结论 FSCN1与HNSCC临床预后显著相关且可作为靶向治疗的一个新靶点.
The expression of FSCN1 in head and neck squamous cell carcinoma and its effect on prognosis based on TCGA database

Head and neck squamous cell carcinomaFascin actin-bundling protein 1PrognosisAnalysis of enrichment

王欣欣、闫振宇、苏博

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南阳市中心医院病理科,河南473000

头颈部鳞状细胞癌 肌动蛋白结合蛋白1 预后 富集分析

2023

中国卫生检验杂志
中华预防医学会

中国卫生检验杂志

影响因子：0.771
ISSN：1004-8685
年,卷(期)：2023.33(13)
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