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通过生物信息学分析筛选弥漫性大B细胞淋巴瘤的关键miRNA和治疗靶点

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目的 基于生物信息学分析的方法寻找影响弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)的关键miRNA和治疗靶点.方法 对GEO数据库中的基因芯片数据进行检索筛选,获取DLBCL相关的非编码RNA(miRNA)表达芯片GSE173080,利用在线分析工具GE02R对芯片数据进行分析,筛选差异表达的miRNA.通过miRWALK软件预测靶基因,并进行miRNA和靶基因的负相关分析.利用DAVID软件对靶基因进行基因本体论(gene ontology,GO)和KEGG通路富集分析.通过STRING软件建立蛋白相互作用网络,并进行聚类分析.此外,通过GEPIA数据库进行靶基因的表达验证.结果 共筛选出34个差异表达的miRNA,包括28个表达上调的miRNA和6个下调的 miRNA.结论 hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-212-3p和hsa-miR-28-5p 是影响 DLBCL 的关键的肿瘤抑制miRNA,其对应的靶基因为将来DLBCL的临床诊断和靶向治疗提供了相关依据.
Screening and identification of key miRNA and therapeutic targets for diffuse large B cell lymphoma through bioinformatics analysis

Diffuse large B cell lymphomaBioinformaticsMiRNATarget gene

赵荣青、郭菲、张威、屠艳烨、李情操、吴巧萍

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宁波市医疗中心李惠利医院检验科,浙江315040

宁波市医疗中心李惠利医院医工融合创新研究院

弥漫性大B细胞淋巴瘤 生物信息学 小分子核糖核酸 靶基因

2023

中国卫生检验杂志
中华预防医学会

中国卫生检验杂志

影响因子：0.771
ISSN：1004-8685
年,卷(期)：2023.33(17)
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