摘要
目的 利用生物信息学分析筛选乳腺癌不良预后的关键基因,为乳腺癌患者的治疗提供新的候选靶点.方法 从GEO数据库中下载得到3个基因芯片表达谱数据集GSE42568、GSE86374和GSE71053,利用在线工具GE02R筛选出差异表达基因(DEGs);然后进行功能富集分析;再利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),用Cytoscape软件对DEGs进行模块分析,获取关键基因(Hub);利用GEPIA和Kaplan-Meier Plotter 2个数据库对筛选出的Hub基因进一步分析和验证.结果 共筛选出121个DEGs,包括上调基因74个,下调基因47个.共筛选出 10 个 Hub 基因:HMMR、RRM2、CDK1、TOP2A、AURKA、CCNB1、MAD2L1、KIF2C、BUB1B、UBE2C.在 GEPIA 数据库中验证显示均高表达.Kaplan-Meier Plotter数据库生存分析,除CDK1外,其余9个关键基因与乳腺癌患者的总体生存率(OS)显著相关.结论 筛选出的9个关键基因与乳腺癌的发生发展和不良预后密切相关,为探索乳腺癌治疗和预测预后提供可能的潜在靶点.
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