目的 基于蛋白质组学技术对半夏和水半夏进行研究,为正确用药提供支持.方法 将半夏和水半夏进行酶解,通过纳升级液相色谱质谱联用方法进行多肽分离及质谱数据采集,采用蛋白质比对软件进行数据处理.结果 两者的多肽图谱具有一定的相似性,在14,19,52和55 min附近均有响应很强的色谱峰,在32和43 min附近两者色谱图有明显的不同.半夏中多肽种类更加丰富,有1346种,比水半夏多312种.半夏和水半夏两者共有的多肽数为296种,共有多肽种类占总多肽种类数分别为22%和29%.含量前10的蛋白质9个是相同的,且主要为凝集素蛋白质,但相对含量差异显著.结论 两者主要多肽及蛋白质在种类和相对含量方面存在明显差异,临床上水半夏不能盲目替代半夏使用.