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基于高通量测序技术对人参花及其易混淆品鉴定研究

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目的 利用高通量测序技术对人参花及其易混淆品进行鉴定,并利用ITS2测序技术验证高通量测序技术对物种鉴定的准确性.方法 对人参花掺伪样品扩增产物进行高通量测序,使用cutadapt、PEAR、PRINSEQ、Usearch、RDP classifier、SINTAX软件获得分类单元(operational taxonomic unit,OUT)序列,舍弃菌类、unclassified等非绿色植物序列;为避免假阳性情况发生,删除序列数＜100条或碱基数＜200 bp的OUT序列.对人参花、西洋参花、三七花的ITS2扩增产物进行测序,利用MEGA 11.0对人参花、西洋参花、三七花的ITS2、OUT、GenBank上下载的碱基序列构建邻接法系统聚类树、遗传距离、种间信息位点及对ITS2、OUT碱基序列分别进行Blast分析来验证高通量测序技术对物种鉴定的准确性.通过构建ITS2及OUT碱基序列二级结构对人参花、西洋参花、三七花进行比对分析,根据物种间二级结构的不同对物种进行鉴定.结果 高通量测序共得到54 653条有效序列,人参花、三七花、西洋参花的序列号分别为OTU1、OTU2、OTU3及对应的有效序列分别为31 325,857,442条.通过对各物种的ITS2及OUT碱基序列进行Blast检索,均支持各个物种.人参花与西洋参花、三七花种间遗传距离分别为0.010,0.033,人参花与西洋参花、三七花分别有2,7个信息位点;邻接法系统聚类树显示各个物种均独立聚为一支,其中人参花与西洋参花聚为一大支与三七花并列.人参花与西洋参花二级结构一致,但与三七花在臂Ⅳ及臂Ⅳ与臂Ⅰ之间有A、B、C 3处不同.结论 基于高通量测序技术能够准确鉴定人参花、西洋参花、三七花,对掺伪样品亦具有较强的鉴别能力,为市售人参花样品鉴定提供一定思路.
Study on Identification of Ginseng Flos and its Confounding Products Based on High-throughput Sequencing Technology

Ginseng FlosQuinquefolii FlosNotoginseng FlosDNA barcodinghigh-throughput sequencingdulterate powder

王孟虎、孙一帆、许亮、康廷国、左亚锋、翟俊杰、李金洋、孟祥松、汤建、王文建

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亳州学院,安徽亳州236800

辽宁中医药大学,辽宁大连116600

亳州职业技术学院,安徽亳州236800

人参花 西洋参花 三七花 DNA条形码 高通量测序 掺伪粉末

辽宁省"百千万人才工程"资助项目安徽高校自然科学研究项目安徽高校自然科学研究项目亳州学院科研项目亳州学院科研项目

KJ2021A1143KJ2020A0765BYZXKTD202004gxbjZD2020095

2023

10.13748/j.cnki.issn1007-7693.20221898

中国现代应用药学
中国药学会

中国现代应用药学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1007-7693
年,卷(期)：2023.40(14)
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