首页|TNC基因敲除对绵羊子宫内膜上皮细胞迁移的影响

TNC基因敲除对绵羊子宫内膜上皮细胞迁移的影响

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
本研究旨在探究TNC(Tenascin-C)基因敲除对绵羊子宫内膜上皮细胞(Endometrial Epithelial Cells,EECs)迁移功能的影响及其内在信号通路,为研究胚胎附植及改善子宫内膜容受性提供借鉴.在TNC外显子 3 和 5 设计和筛选高活性sgRNA,转染绵羊EECs后,通过PCR和RT-PCR鉴定出TNC 6.1 kb片段缺失的绵羊EECs,即plate 1-G3 和plate 2-B5.通过划痕实验检测plate 1-G3 和plate 2-B5 迁移功能变化,并通过RNA-seq和生物信息学分析筛选共差异表达基因(co-Differentially Expressed Genes,co-DEGs),进行GO分析、KEGG分析以及PPI分析.结果表明,TNC基因敲除促进了绵羊EECs的迁移,通过RNA-seq和生物信息学分析筛选出 2 326 个co-DEGs,包括 1 304 个上调co-DEGs和 1 022 个下调co-DEGs.GO分析显示,co-DEGs富集到细胞迁移、粘附、细胞-底物连接等.KEGG分析显示,co-DEGs富集在PI3K-Akt信号通路、ECM-受体相互作用、Rap1 信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等.GO条目中 225 个迁移相关co-DEGs的KEGG分析也富集到类似信号通路.迁移相关DEGs的PPI分析显示,中心枢纽基因有PIK3R3、FN1、FGFR1、ITGB3、PDGFRA等.TNC基因敲除导致绵羊EECs的迁移功能增强并揭示了其相关通路和关键基因,为研究胚胎附植及改善子宫内膜容受性提供了新思路.

汪林丽、朱亚宁、艾越、张效生、韩红兵

展开 >

禽畜遗传改良北京市重点实验室,中国农业大学动物科学技术学院,北京 100193

农业与农村部动物遗传育种与繁育重点实验室,中国农业大学动物科学技术学院,北京 100193

天津市畜禽分子育种与生物技术重点实验室,天津 300381

TNC 子宫内膜上皮细胞 RNA-seq 细胞迁移 功能富集分析

国家自然科学基金

31672418

2024

10.19556/j.0258-7033.20230513-02

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(1)
  • 2