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茶花鸡2号IFN-α基因克隆及生物信息学分析

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本研究旨在克隆茶花鸡 2 号α干扰素基因(IFN-α)CDS区序列并进行生物信息学分析,为后续研究IFN-α基因对茶花鸡 2 号免疫功能的影响提供参考.以茶花鸡 2 号为实验对象设计IFN-α引物,提取总RNA,反转录PCR扩增并克隆其编码区序列,进行生物信息学分析.结果显示茶花鸡 2 号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05,平均疏水指数-0.514,为酸性亲水蛋白,且存在信号肽和1个跨膜区,主要定位于细胞核.IFN-α蛋白被 4 个N糖基化位点、5 个O糖基化位点和 20 个磷酸化位点修饰,主要由α-螺旋与无规卷曲构成.茶花鸡 2 号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%.IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系.本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡 2 号病毒疾病防治中的作用提供理论依据.

刘琛、何永江、豆腾飞、杨明华、潘洪彬、赵素梅、李永能、黄英

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云南农业大学动物科学技术学院/云南省动物营养与饲料重点实验室,云南昆明 650201

云南农业大学组织部,云南昆明 650201

茶花鸡2号 IFN-α基因 基因克隆 生物信息学分析

云南省动物营养与饲料重点实验室开放基金国家蛋鸡产业技术体系建设项目昆明综合试验站项目云南省教育厅科研项目

2021YNPKLANF005CARS-40-S252022J0291

2024

10.19556/j.0258-7033.20221111-03

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(1)
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