摘要
本研究旨在克隆茶花鸡 2 号α干扰素基因(IFN-α)CDS区序列并进行生物信息学分析,为后续研究IFN-α基因对茶花鸡 2 号免疫功能的影响提供参考.以茶花鸡 2 号为实验对象设计IFN-α引物,提取总RNA,反转录PCR扩增并克隆其编码区序列,进行生物信息学分析.结果显示茶花鸡 2 号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05,平均疏水指数-0.514,为酸性亲水蛋白,且存在信号肽和1个跨膜区,主要定位于细胞核.IFN-α蛋白被 4 个N糖基化位点、5 个O糖基化位点和 20 个磷酸化位点修饰,主要由α-螺旋与无规卷曲构成.茶花鸡 2 号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%.IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系.本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡 2 号病毒疾病防治中的作用提供理论依据.
基金项目
云南省动物营养与饲料重点实验室开放基金(2021YNPKLANF005)
国家蛋鸡产业技术体系建设项目昆明综合试验站项目(CARS-40-S25)
云南省教育厅科研项目(2022J0291)
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