中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(1) :229-234,239.DOI:10.19556/j.0258-7033.20221121-03

奶山羊低密度液相SNP芯片开发及有效性验证

程明 孙军昌 曹欣欣 戴正浩 王琦 娄兰强 李和刚
中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(1) :229-234,239.DOI:10.19556/j.0258-7033.20221121-03

奶山羊低密度液相SNP芯片开发及有效性验证

程明 1孙军昌 2曹欣欣 3戴正浩 1王琦 3娄兰强 1李和刚3
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作者信息

  • 1. 青岛市畜牧兽医研究所,山东青岛 266100
  • 2. 青岛市即墨区畜牧业发展服务中心,山东青岛 266200
  • 3. 青岛农业大学动物科技学院,山东青岛 266109
  • 折叠

摘要

为更好地了解奶山羊在世代更替中的遗传谱系,避免因错误谱系记录造成群体近交程度过高,本研究利用液相SNP芯片标记技术确立羊群遗传谱系及其亲缘关系.通过简化基因组测序,对 25 个不同种群的崂山奶山羊基因组DNA样本进行分析,挑选出 1 792 个SNP多态性位点,再通过靶向测序基因型分型,合成低通量的探针,最后对探针进行相应的捕获测试,开发出检测崂山奶山羊遗传基因的低密度液相SNP芯片.将该液相芯片应用于 300 只崂山奶山羊群体的血缘关系鉴定,与已知 300 只奶山羊系谱记录的亲缘关系进行对比,发现结果高度吻合,证明此芯片具有很高的准确性.本实验开发出均一性高、位点多态性好的低密度液相芯片技术,可专门用于崂山奶山羊亲缘关系鉴定,从而更好地指导奶山羊的选种选配.

关键词

奶山羊/液相SNP芯片/杂交捕获测序/亲缘鉴定

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基金项目

青岛民生市科技计划(21-1-4-ny-8-nsh)

山东省农业产业技术体系建设项目(SDAIT-10-03)

出版年

2024
中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
参考文献量11
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