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柴达木牛母系遗传多样性、分化及与我国北方黄牛品种间的遗传关系

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为从分子水平上探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构、遗传背景及与我国北方其他黄牛品种间的遗传关系，本研究对 265 头柴达木牛个体mtDNA D-loop区全序列进行测定，并从GenBank下载了我国北方 13 个其他地方黄牛品种(群体)的 206 条相应序列，以雷州牛为参照对 15 个黄牛品种(群体)的 480 条mtDNA D-loop区序列进行综合分析。结果表明:柴达木牛mtDNA D-loop区核苷酸序列长度在 909～916 bp之间，排除插入/缺失后多序列比对分析共检测到 86 个核苷酸多态位点，包括 15 个单一多态位点和 71 个简约信息位点;依据序列间核苷酸变异在柴达木牛中共确定了 56 种单倍型。遗传多样性分析表明，柴达木牛具有丰富的母系遗传多样性，其单倍型多样度和核苷酸多样度分别为 0。957 3±0。004 1 和 0。161 6±0。080 5;品种内大柴旦、茫崖、都兰 3 个群体相比乌兰、格尔木 2 个群体具有更高的遗传变异，母系遗传多样性水平更高。遗传分化分析表明，柴达木牛品种内群体间存在不同程度的遗传分化(FST=0。020 2～0。192 8)，但各群体间分化程度整体水平较高，部分群体间达到中等及中等以上分化程度。系统发育分析表明，柴达木牛由 2 个母系支系组成，包含普通牛T1～T5和瘤牛I1 6种单倍型组，以T2和T3单倍型组为主，拥有普通牛和瘤牛混合血统，但受到约0。75%的牦牛基因渐渗影响。聚类分析显示，柴达木牛与蒙古牛、秦川牛遗传关系最近，与安西牛、延边牛、长白山牛、沿江牛、西藏牛品种(群体)间聚类关系较近，与哈萨克牛、阿尔泰牛、临夏牛、武威牛亲缘关系较远，而与阿沛甲咂牛、日喀则牛、雷州牛遗传关系最远。

马志杰、魏旭东、盛欣、吴志鹏、陈生梅、雷初朝、晁生玉、韩建林

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青海大学畜牧兽医科学院,青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室,青海西宁 810016

农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室,青海西宁 810016

西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌 712100

青海省海西州农业技术推广服务中心,青海德令哈 817099

国际家畜研究所,肯尼亚内罗毕 00100

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柴达木牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性 分化 系统发育 聚类关系

青海省自然科学基金

2021-ZJ-914

2024

10.19556/j.0258-7033.20231018-06

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(2)
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