摘要
为挖掘新的云上黑山羊高繁品系选育分子标记,研究选取前期GWAS分析获得的位于 11 号染色体上2 个与产羔性状潜在关联位点附近区段内的 103 个SNPs进行单倍型构建,并与产羔性状进行关联分析.结果显示:位点rs26823728上下31 028 376～32 965 139 bp区段内构建出3个单倍型块(b1、b2、b3)11种单倍型,位点rs268284511 上下 47 008 354～48 991 484 bp区段内构建出 6 个单倍型块(d1、d2、d3、d4、d5、d6)21种单倍型;关联分析结果表明,单倍型d1-GG、d2-AA与第2胎产羔数有极显著关联,对该性状具有上调作用,而单倍型d2-TG与第 2 胎产羔数也有极显著关联,但对该性状具有下调作用;单倍型d6-AGCA与第 2 胎产羔数关联显著,对该性状具有上调作用,而单倍型d6-AGCC与平均胎产羔数关联显著,对该性状具有下调作用.综上,本研究从云上黑山羊 11 号染色体上筛选出 4 个与产羔性状显著关联的单倍型、8 个位点并注释到SMYD1、RMND5A、GNLY、SFTPB和USP39 5 个基因上.
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