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云上黑山羊11号染色体单倍型构建及与产羔性状的关联性分析

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为挖掘新的云上黑山羊高繁品系选育分子标记,研究选取前期GWAS分析获得的位于 11 号染色体上2 个与产羔性状潜在关联位点附近区段内的 103 个SNPs进行单倍型构建,并与产羔性状进行关联分析。结果显示:位点rs26823728上下31 028 376~32 965 139 bp区段内构建出3个单倍型块(b1、b2、b3)11种单倍型,位点rs268284511 上下 47 008 354~48 991 484 bp区段内构建出 6 个单倍型块(d1、d2、d3、d4、d5、d6)21种单倍型;关联分析结果表明,单倍型d1-GG、d2-AA与第2胎产羔数有极显著关联,对该性状具有上调作用,而单倍型d2-TG与第 2 胎产羔数也有极显著关联,但对该性状具有下调作用;单倍型d6-AGCA与第 2 胎产羔数关联显著,对该性状具有上调作用,而单倍型d6-AGCC与平均胎产羔数关联显著,对该性状具有下调作用。综上,本研究从云上黑山羊 11 号染色体上筛选出 4 个与产羔性状显著关联的单倍型、8 个位点并注释到SMYD1、RMND5A、GNLY、SFTPB和USP39 5 个基因上。

朱兰、江炎庭、欧阳依娜、涂兴调、赵小红、兰蓉

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云南省畜牧兽医科学院,云南昆明 650224

云南立新羊业有限公司,云南弥勒 650000

云上黑山羊 11号染色体 单倍型 产羔性状 关联分析

国家自然科学基金

31960654

2024

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
年,卷(期):2024.60(2)
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