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基于RNA-Seq分析大白猪和巴马香猪背最长肌组织基因表达差异

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以 180 日龄的大白猪(n=6)与巴马香猪(n=6)为研究对象，屠宰后测定肌内脂肪、肉色、嫩度、pH、滴水损失等肉质性状，采集背最长肌组织提取总RNA，利用RNA-Seq技术鉴定大白猪和巴马香猪背最长肌组织中的表达差异基因及其功能富集通路。结果发现，以大白猪为对照组，在巴马香猪和大白猪背最长肌组织中共鉴定到 5 037 个差异表达基因，其中有 3 326 个上调表达基因，1 711 个下调表达基因。经过KEGG富集通路分析，发现巴马香猪和大白猪一共有168条显著富集通路，其中上调DEGs有92条富集路径，下调DEGs有76条富集路径;GO功能分析中上调表达基因富集到BP有3 058条、CC有413条、MF有559条，下调表达基因富集到BP有 3 050 条、CC有 415 条、MF有 557 条。大白猪与巴马香猪肉色的亮度L在45 min时呈极显著差异;大白猪与巴马香猪之间的肌内脂肪、水分均呈现显著差异。本文对大白猪与巴马香猪肌内脂肪含量进行转录组测序分析，初步认为CAPN3、MTM1、TMOD4等基因在巴马香猪肉质中发挥重要作用。

韦茜尹、雷国凤、陈奎蓉、黄志威、蒋昱雯、陈晓榕、容宁、陈钊、徐玉培、梁晶、兰干球

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广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530004

广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室,广西南宁 530004

广西农业职业技术大学畜牧研究院,广西南宁 530010

巴马香猪 大白猪 RNA-Seq 肉质性状

国家重点研发计划巴马县人才科技计划项目巴马县人才科技计划项目巴马县人才科技计划项目广西大学大学生创新项目

2022YFD1601307巴人科 20210001巴人科 20210009巴人科20220022202110593014

2024

10.19556/j.0258-7033.20230410-06

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(2)
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