中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(3) :149-155.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230206-01

基于转录组测序鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因

韩紫燕 吴申军 鲍海港
中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(3) :149-155.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230206-01

基于转录组测序鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因

韩紫燕 1吴申军 1鲍海港1
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作者信息

  • 1. 中国农业大学动物科学技术学院,北京 100193
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摘要

本研究旨在通过转录组测序(RNA-seq)鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因,为确定雌性鸡胚性腺不对称发育的分子机制提供参考.随机选择 6 胚龄(E6)和 8 胚龄(E8)的雌鸡胚胎各 18~24 只,分离并采集其两侧性腺,每 6~8 个同侧同期性腺组成一个样品,匀浆后提取总RNA经质控后送商业公司进行转录组测序.每个样品 3 个生物学重复.通过基因差异表达分析,GO、KEGG 信号通路分析和基因集变异分析(GSVA),筛选雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因和生物学通路.经实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选出的差异表达基因进行验证.转录组差异表达分析结果显示雌性鸡胚左右两侧性腺在E6 和E8 分别存在 195 个和 315 个差异表达基因.GO功能富集和KEGG信号通路富集分析发现两侧性腺差异表达基因主要富集在卵子发生、细胞发育、piRNA代谢过程等生物学过程并筛选出Pou5f3、STK31、DMRTB1等与鸡胚性腺不对称发育相关的功能基因.本研究为进一步研究雌性鸡胚性腺不对称发育的分子调控机制提供了参考.

关键词

雌性鸡胚/性腺/不对称发育/转录组测序

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基金项目

财政部和农业农村部:现代农业产业技术体系(CARS-40)

出版年

2024
中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
参考文献量27
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