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不同性别滩羊肌内脂肪沉积相关circRNA的鉴定与筛选

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本文研究了滩羊性别差异对背最长肌肌内脂肪的影响以及circRNA对肌内脂肪的调控,旨在为肉羊的品种改良和育肥提供参考.为了分析不同性别滩羊肌内脂肪沉积的变化,本研究进行转录组测序和分析,以分子机理揭示其肉质的差异.其中肌内脂肪(IMF)沉积的分子机制对羊肉品质的改善具有重要研究意义.使用 8 月龄滩羊的背最长肌作为研究材料,并采用RNA-seq筛选在 2 个性别组中差异表达的circRNA,鉴定与这些绵羊IMF沉积相关的circRNA.在鉴定到的 6 101 个候选circRNA中筛选出了 35 个差异表达的circRNAs(DECs),通过对其进行分析可知,以滩羊母羊为对照组,8 个DECs表达量上调,27 个DECs表达量下调.GO功能富集分析结果表明DECs在 42 个GO条目中显著富集,包括:对Wnt受体信号传导途径的正向调节、骨骼肌收缩、肌肉收缩、脂质结合和大分子分解代谢过程等条目;KEGG通路富集分析结果表明,DECs富集在其他类型的O-聚糖生物合成、蛋白酶体、FoxO信号通路、Jak-STAT信号通路、内吞作用和MAPK信号通路等信号通路中.通过进一步筛选总结出与脂肪沉积有关的circRNA,有novel_circ_0007468、novel_circ_0009311、novel_circ_0008785、novel_circ_0007282、novel_circ_0005618、novel_circ_0005616、novel_circ_0006782、novel_circ_0003269.对 6 个随机挑选的circRNA进行实时荧光定量PCR验证,其结果的表达趋势与转录组测序结果一致,这进一步验证了测序结果的准确性.本研究为circRNA调控滩羊IMF沉积提供了更多信息,为未来宁夏优质肉羊新品种(系)的培育提供了有用资源和基础资料.

田彦梅、宋昀静、孟科、尤科梅、冯登侦

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宁夏中卫市沙坡头区畜牧水产技术推广服务中心,宁夏中卫 755000

滩羊 肌内脂肪 环状RNA 性别差异

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NXNYYZ20150101

2024

10.19556/j.0258-7033.20230616-06

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(4)
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