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基于重测序数据分析定安猪遗传多样性及群体结构

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本试验旨在探讨海南定安猪群体的遗传多样性及群体结构，揭示定安猪群体现状。利用全基因组重测序技术对 15 头海南定安猪进行了测序，共获得有效数据 937。38 Gb，平均测序深度为 23。43×，过滤后共检测到 10 946 171 个高质量SNP位点。定安猪的期望杂合度(He)为 0。32、观测杂合度(Ho)为 0。36、核苷酸多态性(pi)为 0。001 6，连锁不平衡程度(LD)分析结果显示衰减速度较快，说明定安猪的遗传多样性较高;系统进化树、主成分分析、群体结构及群体分化指数(Fst)分析发现，所有定安猪个体均聚集为一类，与其他群体间出现明显遗传分化，体现出定安猪的独特性。本研究结果在分子水平为定安猪群体遗传多样性及遗传结构提供了理论支撑，为未来定安猪的保种及创新利用奠定了基础。

倪世恒、钟梓奇、王子轶、谢鑫峰、肖倩

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海南省畜牧技术推广总站,海南海口 571100

海南大学热带农林学院,海南海口 570228

定安猪 SNP 遗传多样性 群体结构 保种

海南省"南海新星"科技创新人才平台项目国家自然科学基金

NHXXRCXM20231332260814

2024

10.19556/j.0258-7033.20230525-06

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(5)
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