中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(5) :147-154.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230623-03

猪泛素化因子的筛选及生物信息学分析

李健 刘亚星 李超程 郭涛 韩雨松 张亚茹 王慧 张永生 贾斌
中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(5) :147-154.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230623-03

猪泛素化因子的筛选及生物信息学分析

李健 1刘亚星 1李超程 1郭涛 1韩雨松 1张亚茹 1王慧 1张永生 1贾斌1
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作者信息

  • 1. 石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000
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摘要

为探究影响猪骨骼肌发育的泛素化因子,本研究通过前期已获得的猪骨骼肌组织的转录组数据,与UniProt蛋白质序列和功能注释数据库中的猪泛素化因子进行比对,成功筛选出FBXL3、FBXL4、FBXL5等泛素化因子.通过生物信息学在线软件对一些关键泛素化因子FBXL3、FBXL4和FBXL6进行分析,得到其空间结构和理化性质等参数.结果显示:FBXL3、FBXL4 和FBXL6 蛋白均为不稳定的亲水蛋白,均不存在跨膜区域,FBXL3、FBXL4 蛋白分别有 44 个和 7 个磷酸化位点,FBXL6 无磷酸化位点,二级结构中无规则卷曲分别占比 36.60%、38.33%、41.08%,FBXL6 蛋白与FBXL3、FBXL7、FBXL8、FBXL12 等多个泛素化蛋白相互作用.本研究成功对猪的泛素化因子进行了筛选,同时进行了系统的生物信息学分析,为解析泛素化因子对骨骼肌的调控作用提供了基础资料.

关键词

/骨骼肌/FBXL家族/生物信息学分析

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基金项目

石河子大学高层次人才科研启动基金(2022ZK022)

&&(校2022032)

出版年

2024
中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
浏览量1
参考文献量29
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