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猪泛素化因子的筛选及生物信息学分析

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为探究影响猪骨骼肌发育的泛素化因子,本研究通过前期已获得的猪骨骼肌组织的转录组数据,与UniProt蛋白质序列和功能注释数据库中的猪泛素化因子进行比对,成功筛选出FBXL3、FBXL4、FBXL5等泛素化因子.通过生物信息学在线软件对一些关键泛素化因子FBXL3、FBXL4和FBXL6进行分析,得到其空间结构和理化性质等参数.结果显示:FBXL3、FBXL4 和FBXL6 蛋白均为不稳定的亲水蛋白,均不存在跨膜区域,FBXL3、FBXL4 蛋白分别有 44 个和 7 个磷酸化位点,FBXL6 无磷酸化位点,二级结构中无规则卷曲分别占比 36.60%、38.33%、41.08%,FBXL6 蛋白与FBXL3、FBXL7、FBXL8、FBXL12 等多个泛素化蛋白相互作用.本研究成功对猪的泛素化因子进行了筛选,同时进行了系统的生物信息学分析,为解析泛素化因子对骨骼肌的调控作用提供了基础资料.

李健、刘亚星、李超程、郭涛、韩雨松、张亚茹、王慧、张永生、贾斌

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石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000

猪 骨骼肌 FBXL家族 生物信息学分析

石河子大学高层次人才科研启动基金&&

2022ZK022校2022032

2024

10.19556/j.0258-7033.20230623-03

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(5)
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