摘要
本研究旨在分析川乡黑猪重要经济性状因果突变和紧密关联SNP位点基因型分布情况,构建川乡黑猪分子系谱.利用全基因组SNP芯片技术对样本进行扫描分析,通过主成分分析、计算遗传距离、ROH分析等对公猪亲缘关系和血统进行划分,解析川乡黑猪的群体结构和遗传多样性.结果显示:川乡黑猪群体中采食量、氟烷(Hal)基因和酸肉基因 2(RN2)已完全剔除非优势基因q;体长基因无QQ基因型和Qq杂合基因型,qq非优势基因型频率达 100%;抗仔猪腹泻和多胸椎数基因Qq、qq基因型总比例分别为 18.07%和26.10%,其中qq基因型比例为 3.21%和 2.01%;公猪精液品质和酸肉基因 1(RN1)的Qq、qq基因型总比例较高,分别为 45.78%和 34.54%,并且Qq基因型比例均超过 30%;多肋骨数和耗料增重比基因中优势基因型QQ比例只有 18.47%和 47.79%,低于 50%.公猪群体主成分分析和聚类分析结果显示,该群体可被划分为 16 个不同的家系.以上结果表明,川乡黑猪的选育可着重于提高抗仔猪腹泻、多胸椎数、多肋骨数、公猪精液品质、酸肉和耗料增重比等基因的优势基因型频率,并结合亲缘关系和家系划分结果,通过分子标记辅助选择技术进一步优化种群结构.
基金项目
国家重点研发计划(2021YFD1301101)
国家重点研发计划(2021YFD1301104)
四川省科技重大专项(2021ZDZX0011)
四川省科技重大专项(2021ZDZX0008)
国家自然科学基金区域创新发展项目(U19A2036)
四川省重点研发计划(2023YFN0088)
四川省重点研发计划(2021YFYZ0030)
四川省重点研发计划(2021YFYZ0009)
四川省重点研发计划(2020YFN0147)
四川省重点研发计划(2022YFN0047)
现代农业产业技术体系建设项目(CARS-35)
现代农业产业技术体系建设项目四川生猪创新团队项目(sccxtd-2023-08)
四川省财政专项(SASA2023CZYX001)
简阳市天府农业科创园科技合作项目(SZ202301)
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