摘要
本试验旨在分析miRNA在茶卡羊和黑藏羊肌肉发育过程中的差异及其对骨骼肌发育调控的影响.采集茶卡羊和黑藏羊的背最长肌组织,构建茶卡羊和黑藏羊背最长肌的small RNA测序文库并测序,运用生物信息学筛选差异表达miRNA,并进行靶基因预测和功能富集.结果表明,2 个文库共鉴定到 126 个已知miRNA和 475 个预测miRNA;筛选到的 12 个差异表达miRNA中有 8 个在黑藏羊中表达量显著上调,4 个miRNA表达量显著下调.这些差异miRNA共预测到 372 个靶基因,显著富集到信号、细胞通信、循环系统发育和细胞过程等GO功能通路.KEGG分析显示靶基因显著富集到剪切体和类固醇激素的生物合成等生物学通路中.同时,选取 6 个miRNAs进行荧光定量验证,qPCR表达趋势与测序分析的表达趋势一致,说明miRNA测序数据可信度较高.本研究从miRNA层面揭示了茶卡羊和黑藏羊骨骼肌生长发育的差异,为进一步研究骨骼肌生长发育的分子调控机制提供了基础数据.
基金项目
青海省自然科学基金(2023-ZJ-981Q)
青藏高原综合科学考察研究项目(第二次)(2019QZKK040104)
中国科学院"西部之光"创新团队项目(CASLWC-2021)
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