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鸡胚胎期肌纤维分化lncRNA相关ceRNA网络构建

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肌纤维的分化直接影响肌肉类型。本研究旨在筛选肌肉中差异表达的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)和小RNA(microRNA,miRNA),构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。试验利用玫瑰冠鸡和科宝鸡胚胎期肌肉组织建立lncRNA、miRNA文库,筛选与肌纤维分化相关的胚胎期骨骼肌差异表达的lncRNA和miRNA,进行靶向关系预测、GO和KEGG富集分析并构建lncRNA相关的ceRNA调控网络。结果显示,共有 953 个lncRNA和 909 个miRNA在胚胎期 8 d和 14 d组间差异表达。基于靶向关系预测、靶基因功能富集分析,筛选出与肌纤维分化相关的lncRNA和miRNA,成功构建包含 41 个lncRNA-miRNA-mRNA关系对的lncRNA相关ceRNA网络。研究结果为丰富后续ceRNA在肌纤维分化的研究提供理论依据,为改善家禽肌肉品质奠定了基础。

张若彤、汪家骏、陈若楠、杨朝永、孙楠桢、董伟、孙杰

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石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000

新疆诺奇拜城油鸡发展有限公司,新疆阿克苏 842008

胚胎期 miRNA lncRNA 肌纤维分化 ceRNA

国家自然科学基金

31860641

2024

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
年,卷(期):2024.60(6)
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