中国畜牧杂志2024，Vol.60Issue(6) ：178-188.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230801-04

鸡胚胎期肌纤维分化lncRNA相关ceRNA网络构建

张若彤 汪家骏 陈若楠 杨朝永 孙楠桢 董伟 孙杰
中国畜牧杂志2024，Vol.60Issue(6) ：178-188.DOI:10.19556/j.0258-7033.20230801-04
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鸡胚胎期肌纤维分化lncRNA相关ceRNA网络构建

张若彤 1汪家骏 1陈若楠 1杨朝永 1孙楠桢 1董伟 2孙杰1
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作者信息

  • 1. 石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000
  • 2. 新疆诺奇拜城油鸡发展有限公司,新疆阿克苏 842008
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摘要

肌纤维的分化直接影响肌肉类型.本研究旨在筛选肌肉中差异表达的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)和小RNA(microRNA,miRNA),构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.试验利用玫瑰冠鸡和科宝鸡胚胎期肌肉组织建立lncRNA、miRNA文库,筛选与肌纤维分化相关的胚胎期骨骼肌差异表达的lncRNA和miRNA,进行靶向关系预测、GO和KEGG富集分析并构建lncRNA相关的ceRNA调控网络.结果显示,共有 953 个lncRNA和 909 个miRNA在胚胎期 8 d和 14 d组间差异表达.基于靶向关系预测、靶基因功能富集分析,筛选出与肌纤维分化相关的lncRNA和miRNA,成功构建包含 41 个lncRNA-miRNA-mRNA关系对的lncRNA相关ceRNA网络.研究结果为丰富后续ceRNA在肌纤维分化的研究提供理论依据,为改善家禽肌肉品质奠定了基础.

关键词

鸡/胚胎期/miRNA/lncRNA/肌纤维分化/ceRNA

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基金项目

国家自然科学基金(31860641)

出版年

2024
中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
浏览量2
参考文献量31
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