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绵羊VPS26A基因克隆、生物信息学及表达谱分析

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为获得绵羊液泡蛋白分选 26A(Vacuolar Protein Sorting 26A，VPS26A)基因CDS序列，确定其生物学功能，明确其在不同品种不同组织的表达差异，以新吉细毛羊和小尾寒羊为试验动物，以小尾寒羊皮肤组织cDNA为模板通过TA(T's and A's Method)克隆获得CDS区序列，并对序列进行生物信息学分析，预测其可能编码的蛋白质结构和功能;利用实时荧光定量PCR检测VPS26A基因在小尾寒羊和新吉细毛羊不同组织的表达差异。结果显示:VPS26A基因CDS序列全长为 981 bp，编码 327 个氨基酸。绵羊VPS26A氨基酸序列与羚羊相似性最高，同源性为 100%，与人的相似性最低，为 99。4%;系统进化树结果显示，绵羊VPS26A与山羊和羚羊亲缘关系最近，与人和驴亲缘关系最远。VPS26A蛋白无跨膜结构域和信号肽，存在27个磷酸化位点和2个N-糖基化位点，主要分布在细胞质和核内体上。VPS26A蛋白二级结构预测结果显示，无规则卷曲、延伸链、α螺旋和β转角分别占 45。87%、30。28%、18。35%和 5。50%，与三级结构预测一致。实时荧光定量PCR结果显示，VPS26A基因在小尾寒羊肺脏中表达量最高，其次是皮肤，而在新吉细毛羊皮肤的表达量均最高，均显著高于其他组织。本研究为进一步阐述VPS26A基因功能奠定了基础。

张双双、王丹、贾琪、陈小辛、刘艺、戢爽、张立春

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吉林省农业科学院动物生物技术研究所,吉林公主岭 136100

延边大学农学院,吉林延吉 133002

小尾寒羊 VPS26A 生物信息学 表达分析 逆转运复合物

吉林省农科院基础科研费项目国家高技术研究发展计划(863计划)校企合作项目

KYJF202JQ0042013AA102506482019021

2024

10.19556/j.0258-7033.20230924-01

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(6)
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