摘要
本研究旨在探究公猪精液性状的遗传机制,挖掘影响公猪精液性状的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)和重要候选基因,以期形成一款公猪育种芯片.基于2个公猪站大白、长白、杜洛克共 451 头公猪精液性状的基因型、表型和系谱数据,采用SAS 9.4 软件的混合线性模型对品种、场次、采精季节、采精月龄、采精频率等因素进行最小二乘法分析;利用DMU软件基于一步法全基因组最佳无偏预测(Single-step Genomic Best Linear Unbiased Prediction,SSGBLUP)模型,采用AIREML方法对精液性状进行遗传参数估计;将基因组育种值(Genomic Estimated Breeding Value,GEBV)作为全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)的反应变量,采用混合线性模型进行关联分析.结果表明:品种、场次-采精间隔、采精季节、采精月龄对公猪各精液性状均有显著影响;精液性状属于中等遗传力性状,精子密度与精子活力呈中等遗传正相关.通过生物学过程分析,确定PFKM、FLT1等 6 个基因是精液性状重要候选基因,精子主段、磷酸戊糖途径和HIF-1 通路是其最重要的 3 个条目或通路.本研究结果为种公猪站选育高繁殖力种公猪提供了有用信息,为揭示公猪精液性状的遗传机制提供了理论基础,可用于精液性状的遗传改良,指导基因组育种.
国家科技期刊平台
NSTL
万方数据