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不同发育时期绵羊乳腺组织lncRNAs筛选、鉴定及功能分析

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长链非编码RNA(long non-coding RNAs，lncRNAs)是一类长度大于 200 个核苷酸(Nucleotide，nt)的非编码RNA分子，它们的表达调控了奶牛和奶山羊的乳腺发育和泌乳性能，但它们调控绵羊乳腺发育的报道较少。为深入研究lncRNAs在绵羊乳腺发育中的作用，本试验以泌乳高峰期和空怀期小尾寒羊的乳腺组织为研究对象，利用RNA-Seq构建lncRNAs表达谱，筛选差异表达lncRNAs，进行靶基因的GO注释和KEGG通路富集分析，并构建lncRNA-miRNA-mRNA的网络互作图。结果表明，4 183 个lncRNAs在绵羊乳腺组织中表达，803 个lncRNAs和 1 637 个lncRNAs仅分别在泌乳高峰期和空怀期乳腺组织中特异性表达。在 2 组之间筛选到 246 个差异表达lncRNAs，其中 28 个lncRNAs在空怀期乳腺组织中上调表达，218 个lncRNAs的表达量显著下调。GO注释和KEGG富集分析发现，差异表达lncRNAs的靶基因显著富集在行为负调节、脂肪垫发育和碳水化合物生物合成过程的调控等条目，以及cAMP、ECM、AMPK和Rap1等信号通路。lncRNA-miRNA-mRNA分析结果表明，差异表达lncRNAs可作为miR-199a-3p、miR-432、miR-200c等的"海绵体"，在绵羊乳腺发育中发挥作用。本研究揭示了小尾寒羊泌乳高峰期和空怀期乳腺组织中lncRNAs的表达特征及生物学功能，为深入研究lncRNAs在绵羊乳腺发育中的调控机制提供了理论依据。

刘艳、郭世伟、甄慧敏、刘圆、胡江、刘秀、李少斌、李明娜、王继卿、郝志云

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甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃省牛羊基因改良工程实验室,甘肃兰州 730070

绵羊 乳腺 长链非编码RNA 泌乳性能

甘肃省基础研究创新群体项目甘肃农业大学学科团队项目兰州市科技计划项目甘肃农业大学校级研究生联合培养基地项目

22JR5RA829GAU-XKTD-2022-212021-1-162GAU2022-008

2024

10.19556/j.0258-7033.20240222-02

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(7)
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