摘要
长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于 200 个核苷酸(Nucleotide,nt)的非编码RNA分子,它们的表达调控了奶牛和奶山羊的乳腺发育和泌乳性能,但它们调控绵羊乳腺发育的报道较少.为深入研究lncRNAs在绵羊乳腺发育中的作用,本试验以泌乳高峰期和空怀期小尾寒羊的乳腺组织为研究对象,利用RNA-Seq构建lncRNAs表达谱,筛选差异表达lncRNAs,进行靶基因的GO注释和KEGG通路富集分析,并构建lncRNA-miRNA-mRNA的网络互作图.结果表明,4 183 个lncRNAs在绵羊乳腺组织中表达,803 个lncRNAs和 1 637 个lncRNAs仅分别在泌乳高峰期和空怀期乳腺组织中特异性表达.在 2 组之间筛选到 246 个差异表达lncRNAs,其中 28 个lncRNAs在空怀期乳腺组织中上调表达,218 个lncRNAs的表达量显著下调.GO注释和KEGG富集分析发现,差异表达lncRNAs的靶基因显著富集在行为负调节、脂肪垫发育和碳水化合物生物合成过程的调控等条目,以及cAMP、ECM、AMPK和Rap1等信号通路.lncRNA-miRNA-mRNA分析结果表明,差异表达lncRNAs可作为miR-199a-3p、miR-432、miR-200c等的"海绵体",在绵羊乳腺发育中发挥作用.本研究揭示了小尾寒羊泌乳高峰期和空怀期乳腺组织中lncRNAs的表达特征及生物学功能,为深入研究lncRNAs在绵羊乳腺发育中的调控机制提供了理论依据.
基金项目
甘肃省基础研究创新群体项目(22JR5RA829)
甘肃农业大学学科团队项目(GAU-XKTD-2022-21)
兰州市科技计划项目(2021-1-162)
甘肃农业大学校级研究生联合培养基地项目(GAU2022-008)
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