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基于基因组重测序的公猪精液品质候选基因研究

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本研究基于某企业公猪站 172 头纯种大白猪 10 316 条精液品质记录，分别针对精液体积、精液密度、有效精子密度、精子活力、精子畸形率以及直线运动比例进行统计分析，绘制每种性状的分布情况。相关性分析发现，精液体积与精液密度呈负相关，精子活力与直线运动比例呈正相关、与畸形率呈负相关。进一步分别选取精液体积性状极端高和极端低的 10 个样品，提取基因组DNA，进行 15×全基因组重测序，共获得高质量SNPs和InDels 11 400 036 个。以 10 kb为window、5 kb为步长进行遗传分化系数(Fixation Index，Fst)分析，以 0。1%的window为阈值，筛选精液体积高低组的极端分化区域，共获得 4。43 Mb的区域，包含 142 个候选基因。利用David工具进行GO富集分析，结果表明候选基因主要参与细胞分裂(GO:0051301)、白细胞运动(GO:1903238)、信号转导(GO:0007165)以及受体聚集(GO:0043113)等生物学过程。其中CDK6、CDK13、CDK14、STAG1和TNKS等基因主要参与细胞分裂过程，且均有与精子质量相关的报道，可作为影响公猪精液品质的候选基因，为后续分子标记的发掘提供理论依据。

雷润雨、阳文攀、冯越、周佳伟、徐忠、李梓芃、吴俊静、乔木、彭先文、梅书棋、张宇

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湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉 430064

华中农业大学动物科学技术学院,湖北武汉 430070

福建傲芯种业科技有限公司,福建漳州 363000

精液品质 公猪 精液体积 候选基因

武汉市重大专项湖北省农业科技创新中心创新团队项目国家生猪产业技术体系

20220213020248532021-620-000-001-18CARS-35

2024

10.19556/j.0258-7033.20230628-05

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)