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硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测

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本研究旨在探究猪胞质 5'核苷酸酶 1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A，NT5C1A)启动子区序列的结构特性，确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点，为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测，在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区，根据预测结果设计 7 对启动子缺失片段引物，以硒都黑猪血液基因组DNA为模板，通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因 5'端 7 个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体，以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测，并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明，NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290～+109 bp的位置(ATG作为+1)，该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5 和SP1 等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。

任双、吴俊静、彭先文、张志红、周佳伟、梅书棋、乔木、杜志强

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长江大学动物科学技术学院,湖北荆州 434020

湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉 430064

江夏区农业农村局农业行政执法大队,湖北武汉 430023

硒都黑猪 NT5C1A 核心启动子区 转录因子 生物信息学

湖北省自然科学基金杰出青年项目国家重点研发计划项目国家生猪产业技术体系项目湖北洪山实验室重大项目

2023AFA0912021YFD1301101CARS-352021hszd003

2024

10.19556/j.0258-7033.20240529-10

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)