摘要
miRNA在成脂分化的过程中发挥着重要的调控作用,本研究旨在探究miRNA在猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)前体细胞成脂分化过程中的表达模式,并对其潜在的调控功能进行分析.通过Small RNA-seq、实时荧光定量PCR、miRanda、RNA hybird等技术和软件,对猪IMF前体细胞成脂诱导分化过程中miRNA的表达模式及靶基因进行了生物信息学分析.结果显示:猪IMF前体细胞诱导 4 d后出现脂滴,在诱导 0 d和 4 d的猪IMF前体细胞中共鉴定到 617 个miRNAs,其中 22 个miRNAs诱导 4 d表达显著上调,27 个miRNAs表达下调;差异miRNAs共预测到 13 869 个靶基因,GO分析和KEGG分析发现靶基因主要富集到细胞分泌、细胞分解代谢、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等.此外,对miR-30 家族的ssc-miR-30a-5p和ssc-miR-30c-3p进行定量验证,验证结果与测序结果一致.本研究揭示了miRNAs在猪IMF前体细胞成脂分化过程中的表达模式及潜在调控网络,为研究猪IMF沉积的调控机制奠定了前期基础.
基金项目
国家自然科学基金项目(32102527)
国家重点研发计划青年科学家项目(2022YFF1001300)
湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003)
湖北省重点研发项目(2023BAA02903)
国家生猪产业技术体系项目(CARS-36)
湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2024-620-000-001-014)