猪肌内脂肪前体细胞成脂分化中miRNA差异分析

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中文摘要：miRNA在成脂分化的过程中发挥着重要的调控作用，本研究旨在探究miRNA在猪肌内脂肪(Intramuscular Fat，IMF)前体细胞成脂分化过程中的表达模式，并对其潜在的调控功能进行分析。通过Small RNA-seq、实时荧光定量PCR、miRanda、RNA hybird等技术和软件，对猪IMF前体细胞成脂诱导分化过程中miRNA的表达模式及靶基因进行了生物信息学分析。结果显示:猪IMF前体细胞诱导 4 d后出现脂滴，在诱导 0 d和 4 d的猪IMF前体细胞中共鉴定到 617 个miRNAs，其中 22 个miRNAs诱导 4 d表达显著上调，27 个miRNAs表达下调;差异miRNAs共预测到 13 869 个靶基因，GO分析和KEGG分析发现靶基因主要富集到细胞分泌、细胞分解代谢、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。此外，对miR-30 家族的ssc-miR-30a-5p和ssc-miR-30c-3p进行定量验证，验证结果与测序结果一致。本研究揭示了miRNAs在猪IMF前体细胞成脂分化过程中的表达模式及潜在调控网络，为研究猪IMF沉积的调控机制奠定了前期基础。

作者：

张新雨、杨涛、吴俊静、乔木、徐忠、张宇、冯越、李梓芃、彭先文、梅书棋、李凤娥、周佳伟

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作者单位：

动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,湖北武汉 430064

华中农业大学农业农村部猪遗传育种重点实验室,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北武汉 430070

关键词：

猪肌内脂肪成脂分化 miRNA

基金：

国家自然科学基金项目国家重点研发计划青年科学家项目湖北洪山实验室重大项目湖北省重点研发项目国家生猪产业技术体系项目湖北省农业科技创新中心创新团队项目

项目编号：

321025272022YFF10013002021hszd0032023BAA02903CARS-362024-620-000-001-014

出版年：

2024

DOI：

10.19556/j.0258-7033.20240615-01

中国畜牧杂志

中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心

影响因子：0.704

ISSN：0258-7033

年,卷(期)：2024.60(8)