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大白猪产仔数性状加权一步法全基因组关联分析

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研究旨在检测影响产仔数性状的基因组区域和候选基因，以期解析猪产仔数性状的遗传结构。以来自 2 个养殖场的 8 938 头大白猪为试验群体(基因分型个体 1 173 头)，研究利用加权一步法全基因组关联分析(Weighted Single-step Genome-wide Association Study，wssGWAS)检测与 1～5 胎的总产仔数(Total Number Born，TNB)和产活仔数(Total Number Born Alive，NBA)显著关联的基因组区域，并根据显著关联区域的物理位置进行候选基因注释及Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析。大白猪产仔数性状的遗传参数估计结果表明，TNB遗传力为 0。11±0。01，NBA遗传力为0。08±0。01。研究共检测到16个显著关联大白猪产仔数性状的基因组窗口(窗口解释超过1%的遗传方差)，这些显著的基因组窗口(0。4 Mb)分别解释了TNB和NBA约 1。0%～2。4%和 1%～3%的遗传方差。根据上述显著的基因组区域，研究共注释到 49 个性状候选关联基因(TRIB2、KCND3、DDX20和RAP1A等)，其中部分基因已被报道与母猪的卵巢发育、激素分泌、乳头数等产仔数性状有关。通过GO和KEGG富集分析，共富集到 3 个GO通路。综上，本研究结果为解析猪产仔数性状的遗传结构提供了新的参考基因，为今后猪繁殖性能选育提供了重要依据。

蔡晓钿、钟展明、魏趁、林清、徐志婷、吴细波、李加琪、张哲

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华南农业大学动物科学学院,广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,国家生猪种业工程技术研究中心,广东广州 510642

广西农垦永新畜牧集团有限公司,广西南宁 530022

大白猪 产仔数性状 加权一步法全基因组关联分析 候选基因 富集分析

国家生猪现代农业产业技术体系广西揭榜制科技项目

CARS-35桂科JB23023003

2024

10.19556/j.0258-7033.20240514-03

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)