摘要
研究旨在检测影响产仔数性状的基因组区域和候选基因,以期解析猪产仔数性状的遗传结构.以来自 2 个养殖场的 8 938 头大白猪为试验群体(基因分型个体 1 173 头),研究利用加权一步法全基因组关联分析(Weighted Single-step Genome-wide Association Study,wssGWAS)检测与 1～5 胎的总产仔数(Total Number Born,TNB)和产活仔数(Total Number Born Alive,NBA)显著关联的基因组区域,并根据显著关联区域的物理位置进行候选基因注释及Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析.大白猪产仔数性状的遗传参数估计结果表明,TNB遗传力为 0.11±0.01,NBA遗传力为0.08±0.01.研究共检测到16个显著关联大白猪产仔数性状的基因组窗口(窗口解释超过1%的遗传方差),这些显著的基因组窗口(0.4 Mb)分别解释了TNB和NBA约 1.0%～2.4%和 1%～3%的遗传方差.根据上述显著的基因组区域,研究共注释到 49 个性状候选关联基因(TRIB2、KCND3、DDX20和RAP1A等),其中部分基因已被报道与母猪的卵巢发育、激素分泌、乳头数等产仔数性状有关.通过GO和KEGG富集分析,共富集到 3 个GO通路.综上,本研究结果为解析猪产仔数性状的遗传结构提供了新的参考基因,为今后猪繁殖性能选育提供了重要依据.
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