摘要
为了保护和利用沙乌头猪种质资源,本研究选择现有 8 个家系的沙乌头猪,采用中芯一号 50K SNP芯片对其进行了群体结构分析,结果表明,243 头沙乌头猪个体的基因型检出率为 95.66%～98.75%,平均值为 98.39%;群体期望杂合度和观察杂合度分别为 0.349 和 0.369.ROH分析结果显示,每个沙乌头猪个体含有的ROH数量为 17～75 个,个体的ROH总长度为 110.94～581.52 Mb,其中 41.56%个体的ROH总长度约300～400 Mb;基于此得出沙乌头猪群体的平均近交系数为 0.13.根据公猪聚类分析,将 26 头公猪大致划分为 7 个家系,并根据 217 头母猪与公猪间的亲缘关系,将它们划分入不同家系,其中 3 头母猪(个体号分别为 7404、13506 和 13708)和检测群体中公猪亲缘关系都比较远,因此将其归类为其他.本研究基于中芯一号 50K SNP芯片技术从遗传水平反映了沙乌头猪种群的群体结构,为沙乌头猪的保种、开发与利用提供了有力参考.
基金项目
中青年教师领军人才培养计划(A6-02RS-23-28)
上海市科技兴农重点攻关项目(2018-02-08-00-03-F01554)
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