中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(8) :210-216.DOI:10.19556/j.0258-7033.20240217-01

全基因组关联分析筛选大白猪产木乃伊数性状候选基因

潘艺 韦佳霖 孙敬春 肖锦红 丁荣荣 杨公社 于太永
中国畜牧杂志2024,Vol.60Issue(8) :210-216.DOI:10.19556/j.0258-7033.20240217-01

全基因组关联分析筛选大白猪产木乃伊数性状候选基因

潘艺 1韦佳霖 1孙敬春 2肖锦红 1丁荣荣 1杨公社 1于太永1
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作者信息

  • 1. 西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌 712100
  • 2. 西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌 712100;中国科学院亚热带农业生态研究所,湖南长沙 410000
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摘要

本研究旨在筛选大白母猪产木乃伊数性状关键候选基因,进而降低母猪产木乃伊率.收集整理了10 036 头丹系大白母猪群体产木乃伊数表型、系谱数据,使用ASReml软件进行遗传参数估计;同时基于Porcine 80K芯片和猪填充服务平台(Swine Imputation Server,SWIM)对 832 头大白猪产木乃伊数性状进行全基因组关联分析.结果显示,在 2、4、7、10、17 号染色体上共鉴定到 31 个显著变异位点,其中PLCB4、SNAP25、HDGFL1、E2F3、ZSCAN12等基因为大白猪产木乃伊数性状的候选基因.这些候选基因富集在甲状腺激素合成、生长调节、卵母细胞生长、生殖细胞发育、动物器官形态发生等信号通路或生物学过程.本研究对解析猪产木乃伊数性状奠定了遗传基础,为猪基因组育种提供了重要参考依据.

关键词

/产木乃伊数/遗传参数估计/全基因组关联分析/基因型填充

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基金项目

国家重点研发计划(2021YFD1301200)

陕西省畜禽育种"两链"融合重点专项(2022GD-TSLD-46)

出版年

2024
中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.704
ISSN:0258-7033
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