摘要
本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因.以 166 头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析.结果表明,有 1 个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1 个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3 个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因.本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值.
基金项目
国家重点研发项目(2021YFD1301101)
四川省重点研发项目(2021YFYZ0030)
四川省重点研发项目(2020YFN0147)
天府农业大师项目(Hezhiping2022)
国家现代农业产业技术体系(CARS-35)
现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(sccxtd-2023-08)
四川省财政专项(SASA2024CZYX001)
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