丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状全基因组关联分析

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中文摘要：本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因.以 166 头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析.结果表明,有 1 个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1 个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3 个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因.本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值.

作者：

王言、顾以韧、梁艳、杨雪梅、杨跃奎、吕学斌、龚建军、陈晓晖、应三成、曾凯、雷云峰、陶璇、何志平

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作者单位：

四川省畜牧科学研究院,动物遗传育种四川省重点实验室,四川成都 610066

关键词：

丫杈猪全基因组关联分析生长发育性状候选基因

基金：

国家重点研发项目四川省重点研发项目四川省重点研发项目天府农业大师项目国家现代农业产业技术体系现代农业产业技术体系四川生猪创新团队四川省财政专项

项目编号：

2021YFD13011012021YFYZ00302020YFN0147Hezhiping2022CARS-35sccxtd-2023-08SASA2024CZYX001

出版年：

2024

DOI：

10.19556/j.0258-7033.20230627-01

中国畜牧杂志

中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心

影响因子：0.704

ISSN：0258-7033

年,卷(期)：2024.60(8)