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伍隍猪线粒体基因组构建与进化分析

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伍隍猪是四川省资阳市伍隍区历史悠久的地方猪品种.本研究首次构建出伍隍猪线粒体基因组全序列,并进一步深入揭示了其mtDNA的结构和特点.研究结果表明,伍隍猪线粒体基因组序列全长为 16 730 bp,碱基含量组成为A(34.64%)、T(25.80%)、G(13.36%)、C(26.20%),总共包括 13 个蛋白编码基因、2 个rRNA基因、22 个tRNA基因和 1 个非编码控制区(D-loop区).22 个tRNA中,除tRNASer(AGY)因缺少DHU臂外,其余tRNA均可以形成典型的三叶草结构.伍隍猪的D-loop区全长为 1 294 bp,包括 26个片段长度为 10 bp的串联重复序列.基于ClustalW多序列比对分析发现,伍隍猪mtDNA序列和四川省 6 个地方猪的mtDNA序列之间的同源性达 99.9%以上,其中共发现了 9 处主要的碱基突变位点.使用MEGA 11基于 22 个国内地方猪品种和国外引进品种的mtDNA序列构建系统进化树,结果发现四川省的 4 个地方猪品种(雅南猪、内江猪、成华猪、青峪猪)聚集成了一个枝簇,而伍隍猪分布于这一簇以外,这也在一定程度上揭示了伍隍猪mtDNA和四川本土地方猪mtDNA之间存在一定的差异.本研究结果为今后进一步开展伍隍猪种质资源的鉴定、开发、利用工作提供了重要的理论依据.

王萌、杨祎挺、甘麦邻、李永红、沈林園、朱砺

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四川农业大学动物科技学院,农业农村部畜禽生物组学重点实验室,四川成都 611130

四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室,四川成都 611130

四川永鑫农牧集团股份有限公司,四川资阳 641300

伍隍猪 线粒体基因组 非编码控制区 系统进化

四川省科技计划四川省科技计划国家生猪产业技术体系国家生猪技术创新中心

2021YFYZ0007scsztd-2023-08-09CARS-pig-35

2024

10.19556/j.0258-7033.20240319-04

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)