摘要
伍隍猪是四川省资阳市伍隍区历史悠久的地方猪品种.本研究首次构建出伍隍猪线粒体基因组全序列,并进一步深入揭示了其mtDNA的结构和特点.研究结果表明,伍隍猪线粒体基因组序列全长为 16 730 bp,碱基含量组成为A(34.64%)、T(25.80%)、G(13.36%)、C(26.20%),总共包括 13 个蛋白编码基因、2 个rRNA基因、22 个tRNA基因和 1 个非编码控制区(D-loop区).22 个tRNA中,除tRNASer(AGY)因缺少DHU臂外,其余tRNA均可以形成典型的三叶草结构.伍隍猪的D-loop区全长为 1 294 bp,包括 26个片段长度为 10 bp的串联重复序列.基于ClustalW多序列比对分析发现,伍隍猪mtDNA序列和四川省 6 个地方猪的mtDNA序列之间的同源性达 99.9%以上,其中共发现了 9 处主要的碱基突变位点.使用MEGA 11基于 22 个国内地方猪品种和国外引进品种的mtDNA序列构建系统进化树,结果发现四川省的 4 个地方猪品种(雅南猪、内江猪、成华猪、青峪猪)聚集成了一个枝簇,而伍隍猪分布于这一簇以外,这也在一定程度上揭示了伍隍猪mtDNA和四川本土地方猪mtDNA之间存在一定的差异.本研究结果为今后进一步开展伍隍猪种质资源的鉴定、开发、利用工作提供了重要的理论依据.
基金项目
四川省科技计划(2021YFYZ0007)
四川省科技计划(scsztd-2023-08-09)
国家生猪产业技术体系(CARS-pig-35)
国家生猪技术创新中心()
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