摘要
本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据.采用PCR产物直接测序法检测 200 头柯乐猪OPN基因第 6 外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0 软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性.结果显示,在OPN基因第 6 外显子中筛查到 5 个SNPs位点,分别为g.131083657 A>G、g.131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点,均产生 3 种基因型,且均为中度多态,其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变,分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸.卡方检验结果显示,5 个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,且 5 个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡.5 个SNPs联合产生 4 种单倍型和 5 种双倍型,突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加,而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱,突变后单倍型H1、H3 在三级结构第 109 个氨基酸前后和 158 个氨基酸处有明显变化.关联分析结果表明,各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关,g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805 C>T、g.131083806 G>C位点有利基因型分别为CC和GG.双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3 个体(GGAAAACCGG)(P<0.05),H1H1和H2H3(GGAGACCTCG)断奶平均重显著低于H1H2.本研究揭示OPN基因第 6 外显子上的 5 个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重 3 个繁殖性能指标均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记.
基金项目
国家重点研发计划子课题(2022YFD1100308-01)
贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2021]5630号)
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2021]一般147)
贵州省生猪产业发展项目(黔财农[2021]157号)
贵州省生猪产业发展项目(黔财农[2022]183号)
贵州省种业发展项目(黔农计财[2022]10号)
贵州省生猪产业技术体系建设项目(GZSZCYJSTX-03)
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