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柯乐猪OPN基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

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本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据.采用PCR产物直接测序法检测 200 头柯乐猪OPN基因第 6 外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0 软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性.结果显示,在OPN基因第 6 外显子中筛查到 5 个SNPs位点,分别为g.131083657 A>G、g.131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点,均产生 3 种基因型,且均为中度多态,其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变,分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸.卡方检验结果显示,5 个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,且 5 个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡.5 个SNPs联合产生 4 种单倍型和 5 种双倍型,突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加,而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱,突变后单倍型H1、H3 在三级结构第 109 个氨基酸前后和 158 个氨基酸处有明显变化.关联分析结果表明,各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关,g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805 C>T、g.131083806 G>C位点有利基因型分别为CC和GG.双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3 个体(GGAAAACCGG)(P<0.05),H1H1和H2H3(GGAGACCTCG)断奶平均重显著低于H1H2.本研究揭示OPN基因第 6 外显子上的 5 个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重 3 个繁殖性能指标均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记.

吴燕、罗华伦、杨红文、杨齐心、王春源、向进、丁义杰、付红梅、赵永、张依裕

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贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州大学香猪研究所,贵州贵阳 550025

黔西南州农业农村局,贵州兴义 562400

贵州省畜禽遗传资源管理站,贵州贵阳 550004

柯乐猪 OPN基因 SNP 繁殖性状

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2022YFD1100308-01黔科合平台人才[2021]5630号黔科合支撑[2021]一般147黔财农[2021]157号黔财农[2022]183号黔农计财[2022]10号GZSZCYJSTX-03

2024

10.19556/j.0258-7033.20240521-08

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

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CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)