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基于选择信号分析挖掘豫南黑猪生长性状关键基因

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生长性状是猪育种中的一个重要指标,也是影响猪生产性能的关键因素之一.豫南黑猪是由河南优良猪种淮南猪和杜洛克猪杂交培育而成.本研究选用 120 头豫南黑猪核心群,利用康普森中芯一号 50K SNP芯片进行基因分型,使用PLINK计算豫南黑猪连续性纯合片段(ROH),并使用selscan软件进行iHH12 选择信号分析,综合筛选影响豫南黑猪群体生长性状的关键基因.结果显示:ROH分析检测到 479 个显著位点,位于 1、6、8、9 号染色体;iHH12 分析检测到 424 个显著位点,分别位于 1、2、3、4、6、7、8、9、11、13、14、15 号染色体;2 种分析方法共得到 132 个重叠位点,在重叠位点区域注释到 85 个基因,分别位于 1、6、8、9号染色体,对其进行功能分析后发现了与脂肪生成、脂质代谢、肌肉发育等生长性状相关的关键基因,包括EHD2、IGFBP7、CPT1C、FGF21等.下一步将利用豫南黑猪的重测序数据对候选基因内及周边连锁区域进行变异位点分析,确定影响豫南黑猪生长性状的关键基因和位点,开发相关育种标记,用于提升豫南黑猪的生长性能.

吴相哲、胡潘阳、郑丽香、乔瑞敏

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河南农业大学动物科技学院,河南郑州 450046

猪 生长性状 ROH iHH12

国家自然科学基金河南省优青项目

U1904115202300410195

2024

10.19556/j.0258-7033.20240607-03

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(8)