摘要
本研究旨在探索DHRS7C基因外显子多态性及其与阳原驴体尺性状的相关性.基于课题组前期阳原驴的体尺性状全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果,选择DHRS7C(Dehydrogenase/Reductase Member 7C)为候选基因,通过PCR扩增其外显子区域、Sanger测序、基因分型以及关联分析等方法,寻找与阳原驴体尺性状显著相关的SNP位点.对显著位点突变前后的mRNA二级结构,蛋白质二、三级结构进行预测比对.结果表明:阳原驴DHRS7C基因外显子区域内存在g.12389830 G>A突变,产生GG、GA 2 种基因型,不同基因型个体之间的体长、胸围、管围差异不显著,体高差异显著,GA基因型个体体高显著高于GG基因型;该突变造成蛋白质第 63 位精氨酸变为赖氨酸,形成错义突变,通过在线网站结构预测,突变前后mRNA二级结构,蛋白质二、三级结构均无明显变化;同时,研究发现该基因还存在g.12397240 G>A、g.12397287 G>A、g.12398389 G>A、g.12398466 G>A 4 个突变,但在本研究驴群中尚未发现它们与体尺性状存在显著相关性.综上所述,DHRS7C基因外显子 3 区域中的SNP(g.12389830 G>A)位点可作为阳原驴体高性状的潜在分子标记.
基金项目
内蒙古科技厅中央引导地方科技发展资金(2022ZY0046)
国家科技期刊平台
NSTL
万方数据