摘要
本研究旨在鉴定北京黑猪与杜洛克猪背最长肌(LDM)组织中的差异表达基因(DEGs),筛选影响猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)沉积的关键基因及通路.研究选取北京黑猪和杜洛克猪各 6 头,采集其背最长肌组织,提取RNA并进行转录组测序.将测序数据进行比对、定量后,利用DESeq2 筛选差异表达基因(|log2FC|≥1,P<0.05)并进行GO分析和KEGG分析.结果表明:2 个品种猪背最长肌组织中共检测到206 个差异表达基因,其中,100 个基因在北京黑猪肌肉组织中高表达,106 个基因在杜洛克猪肌肉组织中高表达.差异表达基因显著富集在 24 条通路,其中AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂质和动脉粥样硬化和脂肪酸代谢等通路参与了脂肪生成和代谢的过程.经进一步分析,ELOVL6、FASN、SCD、SQLE和NR4A1等基因在肌内脂肪生成的过程中发挥关键作用.该研究结果为猪肌内脂肪沉积的分子调控机制提供了参考.
基金项目
科技创新2030重大项目(2023ZD04046)
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