摘要
为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况,利用PCR扩增和直接测序法检测了 63 只赤水乌骨鸡线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区(D-loop)全序列,分析其遗传多样性和单倍型特性,并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析.结果表明,赤水乌骨鸡mtDNA D-loop区全序列共检测到29个突变位点,构成19种单倍型.遗传多样性分析表明,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为 0.990 5±0.018 0、0.006 5±0.000 5 和 7.981.系统发育分析显示,赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G 5个单倍型群,A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类,单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类,E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇南亚种聚为一类.据此推测,赤水乌骨鸡遗传多样性丰富,可能有多个母系起源,主要源于原鸡滇南亚种.
基金项目
遵义师范学院"乡村振兴专项"项目(黔教合KY字[2012]017-17号)
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