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绵羊卵巢组织不同发育阶段miRNA测序及生物信息学分析

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本研究通过构建及分析 2、6、12 月龄小尾寒羊卵巢组织miRNA表达谱,鉴定了不同发育阶段差异表达的miRNAs,并对其进行靶基因预测.结果显示,2 月龄vs 6 月龄、6 月龄vs 12 月龄及 2 月龄vs 12 月龄分别筛选出 11 个、13 个及 19 个差异表达的miRNA,同时分别预测到靶基因 54、37、198 个.进而对这些靶基因进行功能注释及信号通路分析,发现2月龄vs 6月龄差异表达miRNA靶基因主要参与酮的生物合成、铁离子跨膜转运等生物功能及核苷酸剪切修复、Hippo等信号通路;6 月龄vs 12 月龄差异表达miRNA靶基因主要参与tRNA氨酰化、葡萄糖运输等生物过程及TGF-β、卵母细胞减数分裂等信号通路;2 月龄vs 12 月龄差异表达miRNA靶基因富集到多细胞生物过程、碱基生物合成等生物过程及卵母细胞成熟、Rap1 等信号通路.采用qRT-PCR方法对随机选取的 9 个差异表达miRNA进行验证,结果证实了RNA-seq测序的准确性.本研究结果为阐明绵羊卵巢发育的分子调控机制提供了重要理论依据,同时为后续绵羊卵巢miRNA研究提供了基础资料.

谷博、杨一、邓祎婕、孟新超、姜怀志

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吉林师范大学生命科学学院,吉林四平 136000

吉林农业大学动物科学技术学院,吉林长春 130118

小尾寒羊 卵巢发育 miRNA 靶基因预测

吉林省科技发展计划

20210101049JC

2024

10.19556/j.0258-7033.20231106-11

中国畜牧杂志
中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.704
ISSN：0258-7033
年,卷(期)：2024.60(10)