摘要
近交是影响家畜遗传多样性和种群健康的关键因素之一,尤其在高产奶牛群体中,近交可能导致生产性能下降和繁殖力减弱.本研究旨在通过近交系数来反映北京地区3个主要奶牛场的荷斯坦牛群体近交状况,对比分析基于系谱信息和SNP芯片数据 2 种方法计算近交系数,计算个体基于系谱的近交系数(FPED)和基于连续纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的近交系数(FROH),随后对高频ROH区域进行基因注释并鉴定候选基因.结果表明:平均FROH为 0.106 2,波动范围在 0.000 6～0.401 6 之间;平均FPED为 0.025,波动范围在 0～0.292 6 之间.鉴定到来自 8 个高频ROH区域的 63 个与奶牛经济性状相关的基因,如与牛乳脂量相关的基因ABCG2和SCD,与牛生长发育相关的基因NCAPG和PAX2.本研究对改善奶牛的遗传管理和育种规划具有重要意义.
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