浙江省拥有丰富的地方鸡种质资源,但地方鸡遗传背景研究较少,资源深度利用、开发不足.为深入了解地方鸡遗传多样性,促进地方鸡遗传资源开发,本研究采集了浙江省6种地方鸡(江山乌骨鸡、龙游麻鸡、温岭草鸡、仙居鸡、萧山鸡、雁荡麻鸡)血样,基于线粒体DNA变异分析其遗传多样性.单倍型分析结果显示共得到 50 个单倍型,单倍型多样性为 0.974,核苷酸多样性为 0.128.单倍型网络结果表明H9、H26 为优势单倍型,H18～H28、H40～H47 单倍型主要分布于温岭草鸡和萧山鸡群体.系统发育树结果表明,江山乌骨鸡和龙游麻鸡、温岭草鸡和萧山鸡遗传距离较近,雁荡麻鸡具有单独的支系.群体中性检验Tajima's D(0.300,P>0.05)和Fu's Fs(3.786,P>0.05)结果不显著,且错配分布图呈现多峰分布.基因流Nm和遗传分化指数FST分析发现品种间存在不同程度的基因交流与遗传分化,其中江山乌骨鸡和龙游麻鸡之间基因流较为活跃(Nm=22.062),遗传分化程度弱(FST=0.022).本研究基于线粒体DNA遗传多样性分析,初步探究了地方鸡不同遗传背景,为深入研究地方鸡遗传多样性提供了不同思路,对地方鸡遗传资源保护和利用具有重要意义.
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